痢疾通常需要使用抗菌药物来治疗，常用的有诺氟沙星，一般成人每次服用0.2~0.4克，每天3~4次，但18岁以下未成年人禁止使用诺氟沙星，因为可能影响骨骼发育。
抗菌药物治疗
喹诺酮类药物： 如诺氟沙星，对痢疾杆菌有较好的抗菌作用，但18岁以下人群禁用，因为可能影响软骨发育。还有环丙沙星，也可用于痢疾治疗，但同样不建议18岁以下患者使用。头孢菌素类药物： 比如头孢曲松，适用于不能使用喹诺酮类药物的患者，像孕妇、儿童等。它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥抗菌作用，疗效较为可靠。
对症治疗药物
止泻药物： 若腹泻严重，可使用蒙脱石散。它能在肠道表面形成保护膜，吸附病原体和毒素，起到止泻作用，成人每次服用1袋（3克），每天3次，儿童可按体重适当减量服用。补液药物： 痢疾患者容易出现脱水情况，口服补液盐Ⅲ是常用的补液制剂。成人轻度脱水开始时每天服用3000~3500毫升，儿童根据体重按说明书服用，能补充丢失的水分和电解质。
中医中药治疗
黄连素： 具有一定的抗菌作用，对痢疾杆菌有抑制效果，副作用相对较小，成人每次服用0.3~0.4克，每天3次。香连丸： 由黄连和木香组成，有清热燥湿、行气止痛的功效，可用于大肠湿热引起的痢疾，症见大便脓血、里急后重等，成人每次服用3~6克，每天2~3次，小儿酌减。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童患痢疾时用药需格外谨慎，不能随意使用喹诺酮类药物。如果使用头孢菌素类药物，要根据体重准确计算用量，并且密切观察用药后的反应。对于腹泻严重的儿童，使用止泻药物时要注意剂量，避免出现便秘等不良反应。孕妇患者： 孕妇得了痢疾，不能用诺氟沙星等喹诺酮类药物，应选择相对安全的抗菌药物，如头孢菌素类药物。在服用对症治疗药物时，也要咨询医生，确保药物对胎儿没有影响，同时补液要保证足够的量，防止孕妇脱水影响自身和胎儿健康。