寻常疣治疗方法多样，其中物理治疗较为常用，比如冷冻治疗，一般单次费用在几十元到几百元不等，通过低温使疣体坏死脱落，但可能需要多次治疗。
物理治疗方式
冷冻治疗： 利用低温液氮使疣体组织坏死脱落，适用于数目较少的寻常疣。治疗后局部可能出现水疱、结痂，一般1 - 2周结痂脱落。激光治疗： 用激光的高能量烧灼疣体，使其碳化脱落。激光治疗相对快捷，术后恢复时间一般较短，但要注意避免感染。
外用药物治疗
水杨酸： 可以软化角质，使疣体脱落，一般每天外用1 - 2次，连续使用数周，可能会有局部刺激症状，如红肿、疼痛等。维A酸乳膏： 通过调节表皮细胞的分化来发挥作用，需每晚外用一次，可能需要数周甚至数月才能见效，孕妇禁用。
免疫治疗
干扰素： 具有抗病毒和免疫调节作用，可通过局部注射等方式使用，能刺激机体的免疫反应来清除疣体，但可能会有发热等不良反应。不过要注意儿童使用需谨慎评估。寻常疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，免疫治疗通过增强机体对HPV的免疫清除能力来达到治疗目的。