扁桃腺囊肿的治疗方式需根据具体情况而定。一般来说，较小的无症状囊肿可能暂时观察，而较大或有症状的囊肿多需手术治疗。
药物治疗情况
对于扁桃腺囊肿，药物治疗通常不是主要的治疗手段。如果囊肿伴有感染，可能会使用抗生素来控制感染，但药物一般无法使囊肿消失。比如如果是细菌感染引起囊肿周围炎症，可能会用到青霉素类或头孢类抗生素，但这只是针对感染的辅助处理，不能从根本上解决囊肿问题。
手术治疗方式
传统手术切除
如果囊肿较大，影响吞咽、呼吸等功能，通常会采用手术切除。手术一般在局部麻醉或全身麻醉下进行。医生会用手术器械将囊肿完整切除。这种手术的效果较为直接，能快速解决囊肿带来的不适症状，但术后需要一定时间恢复，一般需要1 - 2周左右伤口能基本愈合。不过手术有一定的创伤，术后可能会有疼痛、出血等风险。
微创手术方式
现在也有一些微创手术方法用于扁桃腺囊肿的治疗，比如内镜下囊肿切除术。这种手术创伤相对较小，利用内镜的清晰视野，能够更精准地切除囊肿。与传统手术相比，微创手术术后恢复可能会更快一些，伤口疼痛等不适症状相对较轻，一般术后几天就能明显感觉恢复较好，但同样需要注意术后护理，防止感染等并发症。
日常注意事项
饮食方面
在治疗期间，患者要注意饮食清淡，避免吃辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能会刺激扁桃腺，加重不适。同时要避免吃过硬的食物，以免划伤囊肿部位，引起出血或感染等情况。建议多吃一些富含维生素的蔬菜水果，如苹果、菠菜等，有助于身体恢复。
口腔卫生
要保持口腔清洁，每天早晚认真刷牙，饭后可以用淡盐水漱口，淡盐水有一定的杀菌作用，能减少口腔内细菌滋生，降低囊肿感染的风险。如果是术后患者，更要注意口腔卫生，防止伤口感染，影响恢复。