结石的治疗方法有多种，比如对于肾结石，直径小于6毫米的结石，约有80%~90%的患者可通过保守治疗排出。
药物治疗
利尿排石药：氢氯噻嗪等利尿剂可增加尿量，帮助小结石随尿液排出，但肾功能不全者要慎用。溶石药：对于尿酸结石，别嘌醇能抑制尿酸生成，从而起到一定溶石作用，但服药期间要定期监测血尿酸水平。
手术治疗
体外冲击波碎石：适用于直径在2~5厘米的肾结石或输尿管上段结石，一般经过1~2次碎石治疗，多数结石可被击碎排出，不过凝血功能障碍者不能做此治疗。经皮肾镜取石术：适用于较大的肾结石，如直径大于2厘米的结石，手术是通过经皮肤穿刺建立通道进入肾脏取石，术后需注意伤口护理，防止感染。输尿管镜取石术：用于输尿管中下段结石，利用输尿管镜进入输尿管找到结石并取出，术后要观察尿液情况，看是否有出血等情况。
生活方式调整
饮食控制：对于草酸钙结石患者，要限制菠菜、苋菜等草酸含量高的食物摄入；尿酸结石患者需少吃动物内脏、海鲜等嘌呤高的食物，同时每天饮水量要保持在2000~3000毫升以上，以增加尿量，促进结石排出。运动辅助：适当的运动如跳绳、跑步等有助于小结石的排出，但对于较大的结石，运动时要避免剧烈颠簸，防止结石移动引起疼痛。