卵巢囊肿的药物治疗需根据具体情况而定，一般来说，对于一些较小的、生理性的卵巢囊肿，可能不需要药物治疗，但如果是病理性囊肿，可能会用到一些药物。不过并没有绝对说吃什么药“最好”，要根据病情来选。
生理性卵巢囊肿的情况
生理性卵巢囊肿多与月经周期有关，比如黄体囊肿等，通常会自行消失，一般不需要特殊用药。但要定期复查，观察囊肿变化情况，一般建议间隔1 - 3个月复查超声，看囊肿是否缩小或消失。
炎性卵巢囊肿的药物治疗
如果是炎性卵巢囊肿，可能会使用抗生素来抗炎治疗。常用的抗生素有头孢类抗生素等，比如头孢呋辛酯等。不过使用抗生素要在医生指导下根据感染情况选用，一般需要连续用药一定疗程，比如可能需要用药7 - 14天左右，但具体要根据病情严重程度来定。在使用抗生素期间，要注意观察有无过敏等不良反应，而且不能自行随意停药，以免影响治疗效果。
子宫内膜异位囊肿相关药物
对于子宫内膜异位症引起的卵巢囊肿相关情况，可能会用到一些激素类药物。比如短效避孕药，像复方短效口服避孕药，它可以通过抑制排卵，改变子宫内膜环境等起到一定控制子宫内膜异位症进展、缓解相关症状的作用。一般需要连续服用几个月，比如连续服用3 - 6个月，但这类药物有一定的禁忌证，像有严重肝肾功能不全、血栓病史等情况的人不能使用，用药期间要注意监测肝肾功能等指标。还有GnRH - a类药物，如亮丙瑞林等，这类药物可以抑制卵巢功能，使雌激素水平下降，达到药物性去势的效果，从而缩小囊肿，但使用这类药物可能会引起潮热、骨质疏松等不良反应，一般用药时间不宜超过6个月，而且停药后要注意及时恢复卵巢功能。需要注意的是，不是所有卵巢囊肿都靠吃药治疗，对于一些较大的、怀疑有恶变倾向的卵巢囊肿，可能需要手术治疗。所以发现卵巢囊肿后，要及时就医，医生会根据囊肿的性质、大小、患者的症状等综合判断，制定合适的治疗方案，药物使用也必须在医生的指导下进行。