乳腺囊肿的治疗方法需根据具体情况选择，一般较小且无症状的乳腺囊肿可定期观察，每3~6个月复查乳腺超声。
一、观察随访
无症状小囊肿：对于直径小于1厘米且无明显症状的单纯性乳腺囊肿，通常建议每3~6个月进行一次乳腺超声检查，观察囊肿大小、形态等变化。稳定期囊肿：如果囊肿长时间（如1年以上）大小无明显变化，且超声表现无异常，可继续保持定期随访。
二、药物治疗
对症缓解疼痛：当乳腺囊肿伴有疼痛症状时，可在医生指导下使用非甾体抗炎药，如布洛芬等，来缓解疼痛不适，但药物不能使囊肿消失。调节激素水平：对于因激素水平波动引起的乳腺囊肿，若有必要，医生可能会根据情况考虑使用调节激素的药物，但这类药物使用需谨慎评估。
三、手术治疗
囊肿较大或疑似恶性：如果乳腺囊肿直径大于2厘米，或超声等检查怀疑囊肿有恶变可能，通常需要进行手术治疗。手术方式一般为囊肿切除术，在局部麻醉下即可进行，术后需要对切除的囊肿组织进行病理检查，以明确性质。复发性囊肿：对于经过多次观察随访后仍反复发作的乳腺囊肿，也可考虑手术切除，防止囊肿持续存在带来不良影响。