牙床上长小肉疙瘩，主要考虑以下几种疾病：牙龈瘤、慢性根尖周炎、智齿冠周炎。
一、牙龈瘤。牙龈瘤患者常在唇、颊侧龈乳头处出现肿块，且在刷牙或咀嚼时可能会出血。其主要治疗方法是手术，若切除不彻底则易复发。具体来说，牙龈瘤是牙龈上特别是龈乳头处局限生长的炎性反应性瘤样增生物。它来源于牙周膜及牙龈的结缔组织，因其无肿瘤的生物学特征和结构，故非真性肿瘤。
二、慢性根尖周炎。这种情况下会破坏根尖部位牙槽骨，形成骨膜下脓肿，脓液若突破黏膜则变为黏膜下脓肿，表现为牙龈上的肿胀。对于慢性根尖周炎，急性期需在局部麻醉下切开排脓。慢性根尖周炎多是由于牙髓炎发展而来，牙髓感染通过根尖孔扩散到根尖周组织，引起根尖周炎症。
三、智齿冠周炎。智齿冠周炎患者急性期若未及时治疗会转入慢性期，此时脓液会向前扩散并积聚在第一磨牙的颊侧牙龈上，从而可在牙龈上看到肿胀。在急性期，主要以消炎止痛为主，可利用生理盐水或3%过氧化氢溶液进行盲袋冲洗。智齿冠周炎是指智齿萌出不全或阻生时，牙冠周围软组织发生的炎症。
当出现上述情况时，患者应及时前往口腔医院检查与治疗，切不可忽视。平时要注意保持口腔卫生，掌握正确的刷牙方法。
总之，牙床上长小肉疙瘩可能是多种疾病的表现，应及时就医明确诊断，并采取相应的治疗措施，同时要注重口腔卫生维护。