神经性头痛的治疗药物需根据具体情况选择，常用的有非甾体抗炎药等，一般来说，约70%-80%的患者使用合适药物后头痛能得到不同程度缓解。
非甾体抗炎药类
布洛芬：属于非甾体抗炎药，通过抑制前列腺素合成发挥镇痛作用，能缓解轻至中度的神经性头痛。但有消化道溃疡病史者要慎用，因为可能加重溃疡风险。阿司匹林：也能抑制前列腺素合成，对缓解神经性头痛有一定效果，但哮喘患者需谨慎使用，可能诱发哮喘发作。
阿片类镇痛药
可待因：对于中重度的神经性头痛有一定止痛作用，但长期使用可能成瘾，所以不能随意长期服用，且呼吸抑制患者禁用。曲马多：适用于中度的神经性头痛，不过癫痫患者要慎用，可能诱发癫痫发作。
抗抑郁药
阿米替林：可以用于治疗神经性头痛，尤其适用于伴有抑郁情绪的神经性头痛患者。但老年人使用时要注意可能出现的抗胆碱能副作用，如口干、便秘等，而且孕妇禁用。多塞平：同样对伴有情绪问题的神经性头痛有帮助，使用时要注意可能引起嗜睡等不良反应，青光眼患者禁用。
抗癫痫药
加巴喷丁：可用于神经性头痛的辅助治疗，对于部分因神经异常放电相关的神经性头痛有一定作用。但肾功能不全者需要调整剂量，因为药物主要通过肾脏排泄。普瑞巴林：也可用于神经性头痛的治疗，使用时要关注是否出现头晕等不良反应，有药物滥用史者要谨慎使用。