脊索瘤的治疗主要包括手术治疗、放射治疗等方式。手术是脊索瘤的主要治疗手段，完整切除肿瘤是改善预后的关键，一般来说，完整切除肿瘤的患者5年生存率相对较高。
手术治疗
手术切除原则： 尽量做到肿瘤的全切除。对于位于颅底、脊柱等部位的脊索瘤，手术需要充分暴露病变部位，根据肿瘤与周围重要结构的关系，谨慎操作。例如，颅底脊索瘤手术需要神经外科医生具备高超的技术，要避免损伤周围的神经、血管等重要结构。术后注意事项： 患者术后需要密切观察有无神经功能缺损等情况，同时要加强护理，预防感染等并发症。一般术后需要定期进行影像学检查，评估肿瘤切除情况和有无复发。
放射治疗
常规放疗： 包括外照射放疗，利用射线杀灭肿瘤细胞。对于无法完全手术切除的脊索瘤，或者术后有残留的情况，可辅助进行放疗。一般会根据肿瘤的大小、位置等制定放疗计划，放疗过程中要注意保护周围正常组织，降低放疗不良反应的发生概率。质子放疗： 相对常规放疗，质子放疗对周围正常组织的损伤较小。对于一些病变部位较为特殊，靠近重要器官的脊索瘤患者，质子放疗可能是更好的选择。但质子放疗设备相对较少，治疗费用也相对较高。
药物辅助治疗
化疗药物： 目前针对脊索瘤的化疗药物不是特别多，常用的有达卡巴嗪等。化疗一般作为手术和放疗的辅助治疗手段，用于抑制肿瘤细胞的生长和转移。不过化疗也有一定的不良反应，如骨髓抑制、胃肠道反应等，在使用过程中需要密切监测患者的血常规等指标。靶向药物： 近年来靶向治疗在脊索瘤领域也有一定研究，一些针对特定靶点的靶向药物正在临床试验阶段。但目前还没有广泛应用于临床，需要进一步的研究来验证其疗效和安全性。