卵巢早衰指女性40岁前出现卵巢功能减退，表现为月经异常、雌激素水平降低等。其发病原因较为复杂，主要有以下几方面。
遗传因素导致
染色体异常： 约10% - 20%的卵巢早衰与染色体异常有关，比如X染色体异常，如特纳综合征（45,XO或其变异型），这类女性从出生起就存在染色体的异常情况，会直接影响卵巢的正常发育和功能，导致卵巢早衰发生的概率大大增加。基因突变： 某些特定基因的突变也可能引发卵巢早衰，例如FMR1基因、BMP15基因等发生突变时，会干扰卵巢的正常生理过程，影响卵子的生成和卵巢激素的分泌，进而导致卵巢早衰出现。
自身免疫性疾病影响
多种自身免疫病相关： 像甲状腺疾病（如甲状腺功能亢进或减退）、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，会错误地攻击自身的卵巢组织。例如，在自身免疫性甲状腺疾病患者中，体内产生的自身抗体可能同时影响卵巢的功能，使得卵巢的卵泡逐渐受损，无法正常发挥作用，从而引发卵巢早衰。免疫系统紊乱机制： 当人体免疫系统出现紊乱时，机体的免疫细胞会把卵巢内的正常细胞当作外来异物进行攻击，破坏卵巢的结构和功能，导致卵巢早衰的发生。这种自身免疫性的损伤是一个逐渐发展的过程，会随着时间的推移慢慢影响卵巢的功能。
医源性因素所致
手术影响： 如卵巢囊肿剥除术、输卵管癌根治术、子宫切除术等盆腔手术，如果手术操作不当，可能会破坏卵巢的血液供应或者直接损伤卵巢组织，从而影响卵巢功能。比如在卵巢囊肿剥除术中，如果过度切除卵巢组织，就会减少卵巢内卵泡的数量，影响卵巢正常分泌雌激素和排卵等功能，增加卵巢早衰的风险。放疗化疗影响： 对于一些患有恶性肿瘤的女性，接受盆腔部位的放疗或者某些化疗药物治疗时，射线和化疗药物会损伤卵巢中的卵泡，导致卵泡大量凋亡，进而引起卵巢功能衰退。一般来说，年龄较小的女性在接受这类治疗时，卵巢受到的损伤相对更严重，发生卵巢早衰的可能性也更高。