月经期长时间不干净的原因主要有以下几点：
1.内分泌失调：
激素分泌异常：如果女生经常熬夜、压力过大或处于紧张、焦虑等情绪中，可能会导致内分泌失调，使激素分泌异常，从而引起月经失调，出现经期延长的情况。
黄体萎缩不全：这是由于下丘脑-垂体-卵巢性腺轴反馈调节机制异常引起的。黄体萎缩不全时，子宫内膜不能按时脱落，导致经期延长。
2.子宫肌瘤：
黏膜下肌瘤：子宫肌瘤向子宫腔内生长，突出于子宫黏膜表面，可能会导致月经量增多、经期延长。
肌壁间肌瘤：较大的肌壁间肌瘤可使子宫腔面积增大，宫缩不良，导致经期延长。
3.子宫内膜息肉：
子宫内膜局部过度增生：息肉可能导致子宫内膜面积增大，从而引起月经异常，表现为经期延长、经量增多等。
息肉影响子宫收缩：息肉可能影响子宫正常收缩，导致经期延长。
4.其他：
子宫内膜炎：子宫内膜炎可导致子宫内膜充血、水肿，从而引起月经异常，出现经期延长、经量增多等症状。
宫内节育器：宫内节育器可能刺激子宫内膜，导致局部炎症反应，引起月经异常，出现经期延长、经量增多等症状。
如果出现月经期长时间不干净的情况，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持良好的生活习惯，避免熬夜、过度劳累，保持心情愉悦，注意个人卫生，避免感染。