月经期间第六天进行性行为一般不会怀孕，但也不是绝对的。
月经是女性的一种生理现象，是指子宫内膜周期性脱落及出血。在月经期间，女性的身体会发生一系列变化，其中最明显的就是子宫内膜的脱落和出血。在月经的前半期，卵巢会分泌雌激素，促使子宫内膜生长；在月经的后半期，卵巢会分泌孕激素，使子宫内膜进一步增厚，为受精卵着床做好准备。如果没有受精卵着床，子宫内膜就会脱落，形成月经。
一般来说，女性的排卵期是在下次月经来潮前的14天左右，而在排卵期前后的几天内进行性行为，怀孕的几率会比较高。但是，女性的排卵期并不是固定不变的，它会受到环境、情绪、身体健康状况等因素的影响，因此，安全期避孕的方法并不可靠。
在月经期间，女性的子宫内膜正在脱落，子宫颈口也处于开放状态，此时进行性行为，很容易导致细菌感染，引起子宫内膜炎、盆腔炎等妇科疾病。因此，建议女性在月经期间避免进行性行为，保持外阴清洁，勤换卫生巾。
总之，月经期间第六天进行性行为一般不会怀孕，但也不是绝对的。为了女性的身体健康，建议在月经期间避免进行性行为。如果女性出现月经异常、腹痛、白带异常等症状，应及时就医，以免延误病情。