引起小便疼痛的原因主要包括以下几种，需根据具体情况进行合理治疗。
一、泌尿系统出现感染：当有细菌感染尿道时，会导致尿道黏膜充血水肿甚至损伤，此时在上厕所时，尿液经过受损的尿道黏膜就会产生刺痛感。对于尿道感染，首先可大量饮水，增加尿量，排尿时可冲洗尿道分泌物。还可依据细菌培养和药敏试验来选择有效的抗生素进行抗菌治疗。
1.大量饮水：通过多喝水来促进排尿，起到冲洗尿道的作用。
2.抗菌治疗：根据细菌培养和药敏试验结果，选用敏感的抗生素来消除细菌感染。
二、泌尿系统患有结石：由于结石阻碍了尿道，在小便时会出现刺痛感，同时还可能伴有排尿困难、尿分叉等情况。对于结石较小且无明显嵌顿的患者，可大量饮水并做跳跃动作，以利于结石排出。若合并感染可应用敏感抗菌药物。而结石引起梗阻影响排尿或经非手术治疗无效时，则应考虑手术内镜下碎石或取石。
1.保守治疗：包括多喝水和做跳跃运动，帮助小结石排出。
2.药物治疗：针对合并感染的情况，使用敏感抗菌药物。
3.手术治疗：对于严重梗阻等情况，采取手术内镜下的碎石或取石措施。
三、泌尿系统受到外伤：这些外伤可能会使尿道黏膜受到损害，从而出现血尿或排尿刺痛。一般的小挫伤，患者只需多喝水并口服抗生素预防感染即可。但如果尿道部分裂伤导致患者排尿困难，通常可通过留置导尿管来治疗。
1.小挫伤处理：多喝水和口服抗生素。
2.部分裂伤处理：采用留置导尿管的方式。
四、在行导尿治疗后：拔除导尿管时，前几次小便也会出现刺痛，这种情况通常无需特殊治疗，病人多喝水，随着排尿次数的增加，刺痛会逐渐缓解至消失。
总之，对于小便疼痛的情况，需要明确其具体原因，然后采取针对性的治疗措施，以缓解症状并解决问题。