男生器官上长疱疹通常是由单纯疱疹病毒感染导致的，可在医生指导下使用如下药物：
一、阿昔洛韦软膏：这是一种抗病毒药物。
1.可用于治疗由单纯性疱疹病毒、带状疱疹病毒等引发的皮肤感染，能够减轻疱疹所带来的不适症状，比如瘙痒、疼痛等。
二、盐酸伐昔洛韦片：在使用后能治疗初发和复发的生殖器疱疹病毒感染。
1.也可缓解疱疹引起的各种不适表现。
2.还能用于治疗水痘、带状疱疹等疾病。
此外，生殖器上长了疱疹，除上述药物外，还可遵医嘱应用炉甘石洗剂、喷昔洛韦乳膏等药物进行治疗。
总结：男生器官长疱疹主要可使用阿昔洛韦软膏、盐酸伐昔洛韦片等药物，也有其他一些可选药物，具体应遵医嘱选择合适药物来治疗。