脑干出血多由高血压合并小动脉硬化引起，约70%的脑干出血患者有高血压病史。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤破裂就易导致脑干出血。
高血压因素：
高血压是引发脑干出血的重要原因。长期血压控制不佳，会损伤脑血管壁，使得血管弹性下降、变脆。据统计，有高血压病史的人群发生脑干出血的风险比无高血压者高很多倍。比如，血压长期高于140/90mmHg的人，脑干出血的可能性明显增加。
血管病变因素：
除了高血压相关的血管病变，像脑淀粉样血管病、先天性脑血管畸形等也可能导致脑干出血。脑淀粉样血管病多见于老年人，会使脑内血管的结构和功能发生改变，增加出血风险。而先天性脑血管畸形，如动静脉畸形等，血管结构异常，更容易破裂出血引发脑干出血。
其他诱发因素：
过度劳累、情绪激动等也可能诱发脑干出血。过度劳累会使身体处于应激状态，血压突然升高；情绪激动时，交感神经兴奋，也会导致血压急剧上升，从而促使原本脆弱的脑血管破裂，引发脑干出血。另外，酗酒、吸烟等不良生活习惯也会对血管产生不良影响，增加脑干出血的发生几率。长期大量吸烟会损伤血管内皮，影响血管功能；过量饮酒会使血压波动，加重血管负担。