多发性肾结石的治疗需依据结石大小来选择不同方案，不存在绝对的最佳方案，小于6mm、6～20mm以及大于20mm的结石治疗方式各有不同。此外，还需结合患者是否存在严重感染、尿路梗阻以及是否合并严重高血压、糖尿病等情况综合考虑。以下是具体阐述：
一、结石小于6mm：
1.可先尝试通过大量喝水、适度运动来帮助自行排出结石，每日水的摄入量要保证能使尿液排出量不少于2000毫升。
2.若无法自行排出，可服用排石药促进结石排出，如排石颗粒、结石通颗粒、肾石通颗粒等。
二、结石大小为6～20mm：
此时结石较大，单纯靠喝水和运动难以自行排出，可根据病人具体情况选择体外冲击波碎石、输尿管软（硬）镜取出等方式。
三、结石大于20mm：
由于结石体积过大，碎石缺乏扩散空间，效果会较差且需多次碎石，此时宜选择经皮肾镜碎石的方法来治疗，这样能减少手术时间，更加安全有效。
需注意的是，肾结石大小并非是判断是否需要碎石处理或手术治疗的唯一标准。若存在严重感染或尿路梗阻，或合并严重高血压、糖尿病等情况，应先处理这些问题，再处理肾结石。而且多发性肾结石的治疗确实没有一种通用的最佳方案，即使是同一直径大小的肾结石，因患者身体状况不同、处于疾病不同阶段，治疗方案也会有所差异。此外，开放手术取石也是有效的治疗方式。在治疗过程中，上述药物均需在医生指导下使用，以免延误病情。
总结概况提示：多发性肾结石的治疗要综合多方面因素来选择合适的方案，患者应在医生指导下进行规范治疗，以达到较好的效果。