霉菌性食管炎通常也被称为食管炎，对于食管炎一般要在医生指导下通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等方式来积极处理，由于存在个体差异，所以通常没有绝对的最好治疗方法。
一、一般治疗：
饮食要保持清淡，做到细嚼慢咽以及规律进食，夜间避免吃零食，睡前也不宜进食；要远离烟酒，避免生冷、辛辣、刺激食物；避免暴饮暴食，餐后及反流后可饮用适量的温开水，以减少食物对食管的刺激。
二、药物治疗：
通常需要使用质子泵抑制剂，如奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等；同时要配合使用促胃动力药物，如多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利胶囊等；如果检查发现有真菌感染，还要配合使用抗真菌药物，如伏立康唑片、制霉菌素片等进行治疗。
三、手术治疗：
如果发现有重度异型增生或早期食管癌；难治性溃疡；严重的症状性反流且内科治疗无效时，应及时进行内镜或手术治疗。
如果确诊为食管炎，建议患者不必过度紧张和焦虑，应及时就诊并积极治疗，药物要在医生指导下使用，避免自行用药，以免延误病情，导致不良后果。
总之，对于食管炎要根据具体情况选择合适的治疗方法，同时患者要积极配合治疗，以促进病情的好转。