精索静脉曲张的病因主要与精索内静脉瓣膜缺如、左侧精索内静脉行程长并呈直角注入左肾静脉、左精索内静脉下段位于乙状结肠后面等解剖因素有关，此外，还有以下因素也可能导致精索静脉曲张：
1.生理因素：青壮年性机能较旺盛，阴囊内容物血液供应旺盛。所以有些精索静脉曲张可随年龄增长而逐渐消失。另外，长久站立，增加腹压也是发病困素。
2.静脉血管因素：精索内静脉瓣膜缺如或功能不良导致血液反流，是造成精索静脉曲张的主要原因。左侧精索内静脉行程长并呈直角注入左肾静脉，左精索内静脉血液回流阻力较大，左肾静脉通过主动脉前，在肠系膜上动脉与腹主动脉间受压，影响精索内静脉血液回流，形成近端钳夹现象。左侧精索内静脉无瓣膜，因此血液容易倒流。
3.其他因素：腹膜后肿瘤、肾肿瘤、肾积水等压迫精索内静脉可引起症状性或继发性精索静脉曲张。原发者平卧时很快消失，继发者常不消失或消失很慢。