肛门发痒的原因有多种。一般来说，约30% - 50%的肛门瘙痒与局部皮肤病变有关。
局部皮肤病变因素
肛周湿疹：这是常见原因之一，多因局部潮湿、过敏等引起。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能会有渗出、结痂等表现。比如长期穿不透气的内裤，局部汗液不易蒸发，就容易诱发肛周湿疹导致肛门发痒。痔疮：当痔疮发作时，尤其是内痔脱出或外痔肿胀，会刺激肛门周围的皮肤，导致分泌物增多，进而引起肛门发痒。例如，有痔疮病史的人，在大便后如果没有清洁干净，更容易出现肛门发痒的情况。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒。尤其在夜间，孩子会感觉肛门特别痒，影响睡眠。可以通过检查肛周发现蛲虫或虫卵来确诊。绦虫感染：一般是因为食用了未煮熟的含有绦虫幼虫的肉类等引起。除了可能有消化系统的不适外，也可能会出现肛门发痒的症状，不过相对蛲虫感染来说，发生率稍低一些。
全身性疾病因素
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛门周围皮肤，导致瘙痒。据统计，约有10%的糖尿病患者会出现皮肤瘙痒的并发症，其中包括肛门发痒。肝胆疾病：像肝硬化、胆汁淤积症等肝胆疾病患者，由于胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，会沉积在皮肤下刺激神经末梢，引起全身皮肤瘙痒，肛门部位也可能受累。比如一些肝硬化晚期患者，常伴有皮肤瘙痒的症状，肛门发痒也是其中表现之一。