男肾结石的症状主要有腰部疼痛，大约有一半的肾结石患者会出现腰部隐痛或胀痛，当结石活动引起输尿管梗阻时，会出现剧烈的肾绞痛，疼痛如刀割样，可放射至下腹部、腹股沟及会阴部，疼痛持续时间可能几分钟到数小时不等。
血尿表现
多数患者会出现血尿，可表现为镜下血尿，即通过显微镜才能发现尿液中有红细胞，也有部分患者出现肉眼血尿，尿液颜色呈洗肉水样或鲜红色。一般在活动后血尿会加重。
排尿相关症状
排尿不适： 结石刺激尿路黏膜，患者可能出现尿频、尿急、尿痛等症状。如果结石堵塞尿道，还可能出现排尿困难，尿液排出不畅，甚至尿潴留。恶心呕吐： 当肾结石引起剧烈肾绞痛时，常伴有恶心、呕吐症状，这是因为肾脏和胃肠道的神经有部分是相通的，肾绞痛会反射性引起胃肠道反应。
伴随症状
发热感染： 如果肾结石合并感染，患者会出现发热症状，体温可高达38℃~39℃，同时可能伴有畏寒、寒战，尿液可能变得混浊，有异味。肾功能改变： 长期存在的较大肾结石，可能会影响肾功能，导致肾功能减退，出现尿量减少等情况。但早期可能肾功能改变不明显，需要通过肾功能检查等才能发现。