脑后勺发热可能由多种原因引起，其中常见的有自主神经功能紊乱，这类情况可能持续数周甚至更长时间。
原因一：自主神经功能紊乱
生理性因素：长期精神紧张、压力大、熬夜等都可能导致自主神经功能紊乱，从而出现脑后勺发热的情况。比如长期熬夜的人，连续熬夜超过1周，就较易出现这种神经功能紊乱相关的不适。病理性因素：某些疾病也可能引发自主神经功能紊乱，像内分泌失调等。甲状腺功能亢进患者，由于甲状腺激素分泌过多，机体代谢加快，也可能出现身体局部发热，包括脑后勺发热的现象。
原因二：局部炎症
头皮炎症：头皮发生感染等炎症时，可能出现局部发热。例如头皮毛囊炎，多由细菌感染引起，除了脑后勺发热，还可看到头皮有红色丘疹、脓疱等表现，病程可能持续1 - 2周左右。颈部炎症：颈部的炎症也可能波及脑后勺区域导致发热。比如颈部淋巴结炎，当头部周围组织有炎症时，颈部淋巴结会肿大、疼痛，同时可能伴有局部发热，包括脑后勺附近。
原因三：环境因素
高温环境：长时间处于高温环境中，如夏季高温天气在户外活动超过2小时，身体散热不畅，可能会感觉脑后勺发热。此时体温一般无明显升高，但会有局部发热的主观感受。穿着过厚：穿着过厚的衣物，尤其是在室内活动时，热量不易散发，也可能导致脑后勺部位发热。比如在室内穿着厚重毛衣超过3小时，就可能出现这种情况。