肚子用手按咕咕有水声，可能是以下原因引起：
1.正常生理现象：当胃内有气体和液体时，用手按压腹部可能会产生咕咕的声音，这是正常的肠鸣音。此外，饮水过多或进食了容易产生气体的食物，也可能导致这种情况。
2.消化不良：如果消化不良，食物在胃肠道内停留时间过长，会产生过多气体，导致肚子咕咕有水声。此外，还可能伴有腹胀、腹痛、恶心等症状。
3.肠道菌群失调：肠道菌群失衡可能导致产气细菌增多，从而引起肠鸣音亢进和肚子咕咕有水声。
4.其他：腹部受凉、胃肠道疾病（如胃炎、胃溃疡、肠炎等）也可能导致这种症状。
如果这种情况持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，注意饮食健康，避免食用过多易产生气体的食物，保持腹部温暖，避免着凉。