少精弱精症的原因较多，其中约有30% - 40%的患者是由生殖系统感染导致的，比如附睾炎、前列腺炎、精囊炎等，这些炎症会影响精子的生成、发育和活力。
生殖系统感染因素
附睾炎： 附睾是储存和输送精子的重要器官，当发生附睾炎时，局部的炎症环境会破坏精子生存的微环境，影响精子的质量，导致精子数量减少、活力下降。前列腺炎： 前列腺液是精液的重要组成部分，当前列腺发生炎症时，前列腺液的成分会发生改变，影响精子的营养供应和活动能力，进而引发少精弱精症。
内分泌因素
下丘脑 - 垂体 - 睾丸轴功能异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素、垂体分泌的促性腺激素（如黄体生成素、卵泡刺激素）对睾丸的生精功能和雄激素分泌起着重要的调节作用。如果这个轴出现问题，比如垂体肿瘤导致促性腺激素分泌异常，就会影响睾丸的生精功能，造成精子数量减少、活力降低。甲状腺功能异常： 甲状腺激素也参与生殖系统的调节，甲状腺功能减退时，会导致性激素分泌紊乱，影响精子的生成和活力，从而引发少精弱精症。
精索静脉曲张因素
精索内静脉回流受阻： 精索静脉曲张会使阴囊内温度升高，影响睾丸的生精功能。高温环境会干扰精子的生成过程，导致精子数量减少。同时，静脉曲张还会造成睾丸局部缺氧，影响精子的活力。一般来说，中重度精索静脉曲张患者发生少精弱精症的几率相对较高。
遗传因素
染色体异常： 某些染色体的数目或结构异常会影响精子的生成和发育。例如，克氏综合征患者的染色体核型为47,XXY，这类患者往往存在生精障碍，表现为少精甚至无精，精子活力也会明显下降。基因缺陷： 一些与精子生成相关的基因发生突变或缺陷，也可能导致少精弱精症。比如某些编码精子结构蛋白或参与精子能量代谢的基因出现问题，会直接影响精子的正常功能。