布加综合征治疗方法主要有介入治疗、手术治疗和药物治疗等。其中介入治疗是目前较为常用的方法之一，约60% - 70%的患者可通过介入治疗获得较好疗效。
介入治疗
球囊扩张术： 通过导管将球囊送至病变部位，扩张狭窄或闭塞的血管，一般术后1 - 3天患者症状可有所缓解。该方法创伤相对较小，恢复较快。支架置入术： 在球囊扩张的基础上，置入血管支架，以维持血管的通畅。支架置入后需定期复查，观察支架是否有移位等情况，一般支架可维持数年甚至更久的血管通畅。
手术治疗
分流术： 如腔 - 房转流术等，通过建立血管分流通道，降低门静脉压力，改善血液回流。手术时间一般在2 - 4小时左右，术后患者需要较长时间的恢复，要注意观察有无出血、感染等并发症。根治性手术： 对于一些病变局限的患者可考虑根治性手术，切除病变的血管或血栓等，但该手术风险相对较高，术后并发症发生几率也相对介入治疗稍大。
药物治疗
抗凝药物： 如华法林等，可防止血栓进一步形成和蔓延。但使用华法林时需要定期监测国际标准化比值（INR），一般需将INR控制在2 - 3之间，以达到抗凝效果又避免出血风险。不过药物治疗一般作为辅助治疗手段，单独靠药物很难完全治愈布加综合征。利尿剂： 对于有腹水等症状的患者，可使用利尿剂，如呋塞米等，减轻腹水症状。使用利尿剂时要注意监测电解质，避免出现低钾血症等电解质紊乱情况，一般需要根据患者的尿量和电解质情况调整药物剂量。