小便时尿道刺痛且有异味，初步考虑可能是因平时不注重个人卫生引起，可在便后用温水清洗会阴部，多喝水，观察症状有无缓解。若长时间未缓解，甚至伴有其他不适症状，则怀疑可能是疾病所致，临床上常见于尿路感染、前列腺炎等。此时应及时就医明确原因，确诊后予以针对性治疗，以防病情加重。
一、尿路感染
1.尿道炎：主要由不良生活卫生习惯、不洁性生活等导致淋球菌、非淋球菌感染引起。因尿道存在炎症感染，会损伤尿道黏膜，且尿液中会有一些脓性分泌物，从而使患者出现小便时尿道刺痛、有异味的现象，还常伴有尿频、尿急等症状。
对于淋菌性尿道炎，可遵医嘱选用头孢克肟片等抗生素进行抗感染治疗；
对于非淋菌性尿道炎，可遵医嘱选用左氧氟沙星片、罗红霉素片等抗生素进行治疗。
二、前列腺炎
主要由频繁手淫、久坐、不注意生理卫生、饮食不规律等引发前列腺感染而致。患者会有局部炎症反应，继而易引起小便刺痛，伴有尿液异味，可能还会出现尿频、尿急、尿滴白、会阴部胀痛等症状，严重时可引起性功能障碍。确诊后，可遵医嘱使用前列舒通胶囊、左氧氟沙星片等药物进行治疗，同时还需配合一些物理治疗，如温水坐浴、前列腺手法按摩等，以助于疾病恢复。在治疗过程中，要加强日常护理，多喝水促进排尿，反复冲刷尿路，同时禁止性生活，清淡饮食，注意生理卫生，勤换洗衣物，有利于身体康复。
总之，当出现小便时尿道刺痛有异味的情况时，应根据具体情况采取相应措施，若与疾病相关，需积极治疗并做好日常护理。