血管瘤的引起原因目前尚未完全明确，可能与多种因素有关。一般认为，胚胎发育过程中血管发育异常或残留是重要因素之一。
遗传因素相关情况
部分遗传倾向： 有研究发现，某些类型的血管瘤可能存在一定的遗传易感性。比如部分婴儿血管瘤患者，其家族中可能有类似疾病的发病情况，但具体的遗传方式还不十分清晰，目前已知是多基因参与的复杂遗传模式，不过具体的遗传概率并没有一个确切的如同单基因遗传病那样精准的数字，只是有家族聚集性的相关观察。
胚胎发育时期的影响
血管形成机制异常： 在胚胎发育的早期，血管系统的形成过程中出现紊乱。例如，在胚胎发育的第3 - 8周时，血管生成相关的信号通路出现异常，导致血管内皮细胞的增殖、迁移等过程发生紊乱，从而形成异常的血管团块，进而发展为血管瘤。像在这个时期，如果受到一些不良因素的干扰，比如母体在孕期接触了某些可能影响血管发育的物质，就可能增加胎儿患血管瘤的风险。母体环境因素： 母亲在孕期的一些状况也可能影响胎儿血管瘤的形成。比如孕期母亲患有糖尿病，研究发现患糖尿病的母亲所生育的婴儿患血管瘤的概率相对正常孕妇生育的婴儿会有所升高。另外，孕期母亲受到辐射等不良物理因素影响，也可能干扰胚胎的血管发育，使得血管瘤的发生几率增加。
细胞因子相关因素
血管内皮生长因子作用： 血管内皮生长因子（VEGF）在血管瘤的发生发展中起到重要作用。在血管瘤增生期，体内VEGF的水平会明显升高，它会刺激血管内皮细胞的增殖，促使血管瘤快速生长。而在血管瘤消退期，VEGF水平又会下降，血管内皮细胞增殖受到抑制，血管瘤逐渐消退。不过具体的VEGF水平变化与血管瘤具体关系的精准机制还在不断深入研究中，但已经明确其是重要的相关因素之一。总之，血管瘤的引起是多种因素综合作用的结果，目前对于其确切的发病机制还在持续研究中，不同类型的血管瘤可能具体的诱发因素又各有特点。