小婴儿感染幽门螺杆菌时症状往往不典型，部分可能没有明显症状，也有一些会出现反复呕吐，通常呕吐没有明显的季节性，可能在进食后就发生，呕吐物多为胃内容物；还可能有食欲减退的情况，小婴儿原本正常的奶量可能会明显减少。
消化系统相关表现
腹痛表现：小婴儿可能会出现哭闹不安，尤其是在进食后或者夜间可能会有哭闹加重的情况，但由于小婴儿不会准确表达，只能通过肢体动作和哭闹来体现。恶心表现：有时候能观察到小婴儿有想要干呕的动作，但很难吐出东西。
生长发育方面影响
体重增长缓慢：如果幽门螺杆菌感染影响了小婴儿的消化吸收功能，就可能导致体重增长跟不上正常的速度，对比同月龄正常喂养的婴儿体重会偏低。身高增长可能受限：长期的消化功能受影响，也可能会对身高的增长产生一定的阻碍，使得身高增长速度比正常婴儿慢。
其他可能表现
贫血倾向：幽门螺杆菌感染可能会引起小婴儿慢性失血，从而导致缺铁性贫血，表现为面色苍白，尤其是口唇、甲床等部位比较明显，而且小婴儿可能会有精神欠佳、活动减少的情况。反复口腔异味：部分感染幽门螺杆菌的小婴儿可能会出现口腔有异味的情况，但这种表现相对不典型，需要结合其他症状综合判断。