飞秒激光近视眼手术存在后遗症但不常出现。后遗症包括干眼症、角膜瓣崩裂、视力回退、青光眼、眩光、夜晚视觉质量差、角膜内皮营养不良、圆锥角膜等。原因主要是屈光度数矫正不足或过矫致视物模糊，术后不注意卫生引发感染致角膜糜烂进而引起一系列眼部疾病。术前患者务必进行相关检查以确定是否适合手术。
一、飞秒激光手术分全飞秒激光和半飞秒激光。
1.全飞秒激光手术：利用飞秒激光制作角膜透镜使视力恢复正常，手术精确、效果理想、损伤小且恢复时间短，可降低后遗症发生几率。
(1)通过该手术能较为精准地矫正视力。
(2)术后效果较好。
(3)对眼部的损伤相对较小。
(4)能让恢复时间缩短。
2.半飞秒激光：需制作角膜瓣并对角膜基质层切削再取出，有瓣下感染、瓣复位不良及瓣下混浊可能，但可二次手术和再次矫正。
(1)手术过程中要制作角膜瓣。
(2)存在一些特定风险。
(3)具备二次手术和再次矫正的优势。
总之，飞秒激光近视眼手术有不同类型，各有特点和风险，患者术前要做好检查和评估，根据自身情况选择合适的手术方式。