肚子有时疼有时不疼可能由多种原因引起。比如胃肠道功能紊乱时，约有30% - 40%的人会出现这种腹部不定时疼痛的情况。
胃肠道功能紊乱导致
饮食因素： 如果近期经常吃辛辣、油腻、刺激性食物，像一天内吃了2 - 3顿麻辣烫，就可能刺激胃肠道，引起胃肠功能紊乱，出现肚子有时疼有时不疼的情况。而且如果吃饭不规律，饥一顿饱一顿，也会打乱胃肠道的正常节律，导致腹部不适反复出现。精神因素： 长期处于紧张、焦虑、压力大的状态下，比如学生考试前压力大，就可能影响植物神经功能，进而影响胃肠道的蠕动和消化，造成肚子有时疼有时不疼。
消化系统疾病引起
慢性胃炎： 患有慢性胃炎的人，胃黏膜处于受损状态，进食后胃酸分泌刺激受损黏膜就会引起疼痛，但有时胃酸分泌相对平稳时疼痛就会缓解，所以会出现有时疼有时不疼的情况。一般有10% - 20%的慢性胃炎患者会有这样腹部不定时疼痛的表现。肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠病，患者肠道较为敏感，食用某些特定食物，像喝了一杯冰饮料后，肠道受到刺激就会疼痛，但过一会儿刺激因素消除，疼痛可能就减轻或消失，从而表现为肚子有时疼有时不疼。
腹部脏器其他问题
胆囊结石： 当胆囊结石移动时，可能会刺激胆囊壁，引起右上腹的疼痛，但结石有时位置相对固定，疼痛就会缓解，所以会出现有时疼有时不疼的状况。一般在有胆囊结石人群中，约15% - 20%会出现这种不定时的腹部疼痛表现。泌尿系统结石： 比如输尿管结石，结石在输尿管内移动时，会引起腹部一侧的疼痛，但结石移动到相对平缓位置时，疼痛就会减轻或消失，也会出现肚子有时疼有时不疼的情况。在泌尿系统结石患者中，有部分人会有这样不定时腹痛的表现。