治疗乙肝并没有绝对“最好”的药物，目前常用的抗乙肝病毒药物有核苷（酸）类似物和干扰素两类。例如恩替卡韦属于核苷（酸）类似物，它能抑制乙肝病毒多聚酶，从而抑制病毒复制，一般需要长期服用，价格方面不同规格有所差异，国产的恩替卡韦一盒（0.5mg*28片）大概几十元。
核苷（酸）类似物类药物
恩替卡韦： 它对乙肝病毒复制的抑制作用较强，能有效降低乙肝病毒DNA水平，长期应用耐药发生率较低。但要注意，肾功能不全的患者使用时需要调整剂量。替诺福韦酯： 也是常用的核苷（酸）类似物，抗病毒效果较好，对骨骼和肾脏的安全性相对较好，但可能会有胃肠道不适等副作用，不过发生率较低。
干扰素类药物
普通干扰素： 需要每周皮下注射3次，疗程相对固定，一般为1年左右。它除了有抗病毒作用外，还可能调节机体免疫功能，但使用时可能会出现流感样症状，如发热、头痛、肌肉酸痛等，一般在用药初期比较常见。聚乙二醇干扰素： 是长效干扰素，每周皮下注射1次即可，抗病毒疗效相对较好，疗程通常也是1年左右，但同样可能出现流感样症状等不良反应，不过总体耐受性相对普通干扰素有所改善。
药物使用的注意事项
对于乙肝患者来说，药物的选择需要根据患者的具体情况来定，比如病情的严重程度、肝功能情况、有无肝硬化等。一般来说，核苷（酸）类似物适合大部分慢性乙肝患者长期服用来控制病毒复制；而干扰素适合部分适合干扰素治疗的患者，比如年轻、无干扰素禁忌证、希望较短疗程获得病毒学应答等情况的患者。但使用这些药物都需要在医生的严格指导下进行，要定期监测肝功能、乙肝病毒DNA、乙肝五项等指标，以便及时调整治疗方案。同时，在用药过程中要注意药物的不良反应，如有不适及时就医。