滴虫性阴道炎主要通过药物治疗，通常全身用药为主，首选甲硝唑，一般单次口服2克即可见效。
药物治疗选择
甲硝唑： 是治疗滴虫性阴道炎的常用药物，它能抑制滴虫的氧化还原反应，使原虫氮链断裂，从而起到杀灭滴虫的作用，一般单次口服2克就能有较好效果。替硝唑： 也可用于治疗滴虫性阴道炎，替硝唑的疗效与甲硝唑相当，可以口服，也可以阴道局部用药，口服时一次1克，每日1次，连服3日。
治疗中的注意事项
性伴侣同治： 滴虫性阴道炎主要通过性行为传播，所以性伴侣也需要同时接受治疗，否则容易重复感染。治疗期间的生活注意： 在治疗期间要避免性生活，同时要保持外阴清洁，每日用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤要煮沸消毒，避免交叉感染。
特殊人群的处理
孕妇： 孕妇患滴虫性阴道炎时，治疗需谨慎，一般建议在妊娠20周以前避免口服甲硝唑，可选择阴道局部用药，如甲硝唑阴道泡腾片等，但具体用药需在医生指导下进行，因为妊娠早期服用甲硝唑可能会对胎儿产生一定影响。哺乳期女性： 哺乳期女性使用甲硝唑时，药物可能会通过乳汁分泌，影响婴儿，所以哺乳期女性用药也需要咨询医生，权衡利弊后再决定是否用药以及选择合适的用药方式。