喝绞股蓝茶一般副作用较少，但也可能存在一些情况。一般来说，正常饮用绞股蓝茶时副作用相对轻微，但长期大量饮用可能会有一些影响。
对胃肠道的影响
刺激肠胃： 部分人喝绞股蓝茶后可能出现胃肠道不适，比如少数人会有胃部不适的感觉，像微微的胃痛或胃胀。如果本身肠胃比较敏感，空腹大量饮用绞股蓝茶，这种胃肠道不适的情况可能更易发生。腹泻风险： 个别人群对绞股蓝茶比较敏感，饮用后可能出现腹泻症状，不过这种情况相对较少见。一般每天饮用超过一定量（比如超过500毫升持续较长时间）时，出现腹泻的可能性会有所增加。
对神经系统的影响
轻度镇静： 绞股蓝有一定的镇静作用，个别人饮用后可能会感觉有点困倦，尤其是在晚上饮用较多绞股蓝茶时，这种困倦感可能更明显。比如晚上喝了较浓的绞股蓝茶200毫升以上，可能会比平时更容易犯困。影响睡眠： 对于睡眠浅的人来说，大量饮用绞股蓝茶可能会影响睡眠质量，导致入睡困难或睡眠变浅。如果本身睡眠就不太好，晚上饮用超过300毫升的绞股蓝茶，可能会加重睡眠问题。
对免疫系统的影响
免疫调节争议： 绞股蓝被认为有免疫调节作用，但过量饮用可能会产生相反效果。长期大量饮用（每天饮用超过1000毫升持续3个月以上）可能会对免疫系统产生不良影响，不过这种情况比较少见，需要长期大量饮用才可能出现。特殊人群需注意： 本身免疫系统有问题的人群，比如正在接受免疫治疗的患者，饮用绞股蓝茶前最好咨询医生，因为不确定绞股蓝茶是否会干扰免疫治疗效果，一般不建议自行大量饮用绞股蓝茶。
对肝肾功能的影响
短期影响较小： 正常剂量短时间饮用绞股蓝茶，对肝肾功能影响不大。一般短期饮用每天不超过300毫升，持续1 - 2周，对肝肾功能指标基本不会有明显改变。长期大量饮用风险： 长期大量饮用（每天超过800毫升持续半年以上）可能会加重肝肾代谢负担，虽然这种情况发生肝肾损伤的概率较低，但对于本身肝肾功能不太好的人群，比如有轻度脂肪肝或轻度肾功能不全的人，就需要特别谨慎，最好在医生指导下饮用绞股蓝茶。