宝宝睡着时咳嗽的原因包括呼吸不畅、环境因素、过敏等。以下是具体分析：
一、呼吸不畅：
1.可能与睡觉体位有关，致使宝宝呼吸受阻，刺激咽喉部引发咳嗽，改变体位后咳嗽通常会消失。
2.也可能是上呼吸道感染造成呼吸不畅，伴随咽痛、咳嗽、发热等症状，可在医生指导下使用小儿解感颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒、小儿柴桂退热颗粒等药物进行治疗。
二、环境因素：
1.所处环境空气过于干燥、不流通或有刺激性气味，会刺激宝宝咽喉黏膜，导致咽喉不适而出现刺激性干咳。
2.可通过多喝水、使用加湿器等方法缓解，同时要保持室内空气流通，勤开窗通风，若咳嗽严重应及时就医。
三、过敏：
1.可能是过敏因素导致患儿出现咳嗽变异性哮喘，常夜间咳嗽严重，白天几乎不咳。
2.可遵医嘱使用盐酸二氧丙嗪片、盐酸西替利嗪片、盐酸苯海拉明片等药物治疗，同时要保持室内清洁，避免吸入二手烟。
家长要多留意天气变化，及时给宝宝增减衣物，以防着凉。此外，还有可能是支气管炎所致，可遵医嘱服用阿莫西林颗粒等药物治疗，具体应在医生指导下进行。总之，当宝宝睡着时咳嗽，应明确具体原因并采取相应的措施。