孟鲁司特钠咀嚼片有一定副作用，但总体发生率相对较低。据临床观察，约有1% - 3%的患者可能出现一些轻微的副作用。
常见的神经系统副作用
头痛：部分患者服用后可能出现头痛症状，不过大多数为轻度，一般不影响继续用药，通常在用药过程中可逐渐适应。嗜睡：少数人会有嗜睡的表现，在用药初期可能比较明显，所以用药后需要驾驶或操作机械的患者要注意，可能会影响反应能力。
消化系统方面的副作用
恶心：有的患者会出现恶心的情况，一般程度较轻，多数不影响药物的使用，随着用药时间推移可能会减轻。腹泻：个别患者可能出现腹泻症状，一般也是轻度的，若腹泻严重需及时就医评估是否需要调整用药。
其他方面的副作用
过敏反应：极个别患者可能出现过敏反应，如皮疹、瘙痒等，一旦出现过敏症状应立即停药，并及时就医。不过这种过敏情况发生的概率非常低。精神系统异常：偶尔有患者会出现焦虑、抑郁等精神方面的异常表现，但发生几率极低，若出现此类情况需密切关注并向医生反馈。