慢性肠炎主要症状包括消化系统症状、全身症状等。一般来说，慢性肠炎患者常见的消化系统症状表现为长期反复发作的腹痛，疼痛程度不一，多数为隐痛或胀痛，发作频率可能为每周数次不等；还会有腹泻情况，大便次数增多，可为每天3 - 5次甚至更多，大便性状多为稀便，有的可能带有黏液，严重时可能出现脓血便。
消化系统症状表现
腹痛： 慢性肠炎患者的腹痛部位多不固定，一般以下腹部为主，疼痛性质多样，有的是隐痛，有的是钝痛，在进食生冷、油腻食物后可能会加重。比如吃了一顿油腻的大餐后，腹痛可能会明显加剧。腹泻： 腹泻是常见症状之一，大便通常呈糊状，每日排便次数不等，轻者2 - 3次，重者可达10余次。部分患者还可能伴有里急后重感，即有排便不尽的感觉。
全身症状体现
乏力： 由于肠道长期慢性炎症，营养吸收受到影响，患者会出现全身乏力的情况，活动耐力下降，稍微活动就会感觉疲惫。例如原本可以快走半小时，患病后可能走10分钟就觉得很累。消瘦： 长期腹泻和消化吸收不良会导致患者体重逐渐下降，出现消瘦的表现。如果病情得不到有效控制，体重可能会在数月内下降5 - 10斤甚至更多。
其他伴随症状
腹胀： 慢性肠炎患者常伴有腹胀，尤其是在进食后更为明显。胃肠道内气体排出不畅，导致腹部胀满不适。比如吃了一碗米饭后，腹部很快就会感觉胀满。恶心呕吐： 部分患者可能会出现恶心，严重时会伴有呕吐，尤其是在病情发作比较严重的时候。呕吐物多为胃内容物，一般没有胆汁等其他物质。