儿童阴茎短小可能是由多种原因引起的，治疗方法因病因而异。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.隐匿性阴茎：这是一种常见的先天性畸形，阴茎体缩藏于体内，凸出外面的只有尖尖的小包皮。如果确诊为隐匿性阴茎，不伴有其他畸形，且阴茎发育不良、勃起时阴茎长度正常，则不需要特殊治疗，只需定期观察。如果阴茎发育不良，勃起时阴茎长度小于5厘米，则需要手术治疗，通过松解阴茎根部的纤维条索，使阴茎暴露出来。
2.雄激素缺乏：如果儿童体内缺乏雄激素，会导致阴茎发育不良，出现阴茎短小的情况。这种情况下，需要补充雄激素，促进阴茎的发育。常用的雄激素有十一酸睾酮胶丸、注射用绒促性素等。
3.其他原因：如果儿童患有某些疾病，如先天性肾上腺皮质增生症、低促性腺激素性性腺功能减退症等，也会导致阴茎短小。这种情况下，需要针对病因进行治疗，同时可以使用一些药物来促进阴茎的发育，如促性腺激素释放激素类似物、人绒毛膜促性腺激素等。
需要注意的是，儿童阴茎短小的治疗需要在专业医生的指导下进行，医生会根据儿童的具体情况制定个性化的治疗方案。同时，家长也应该注意儿童的心理发育，避免因为阴茎短小而给儿童带来心理上的压力。