肠系膜脂膜炎的病因目前尚未完全明确，可能与多种因素有关。目前认为可能与外伤、感染、自身免疫等因素相关。
与外伤的关联
有研究发现，腹部受到外伤可能是诱发肠系膜脂膜炎的一个因素。比如腹部曾遭受过较为严重的撞击等外伤情况，可能会导致肠系膜局部的组织损伤，进而引发后续的一系列病理改变，最终出现肠系膜脂膜炎的相关表现。
与感染的关系
某些感染性因素也可能参与肠系膜脂膜炎的发生。例如细菌感染，当肠道等部位发生细菌感染后，炎症反应可能会波及肠系膜，长期的炎症刺激可能促使肠系膜脂膜炎的形成。像一些肠道的慢性细菌感染，持续的炎症状态会影响肠系膜的正常结构和功能，增加患肠系膜脂膜炎的风险。
与自身免疫的联系
自身免疫因素也不容忽视。人体自身的免疫系统出现异常时，可能会错误地攻击肠系膜组织。比如自身免疫性疾病患者，其免疫系统处于紊乱状态，可能会对肠系膜的脂肪组织等发起攻击，引发炎症反应，逐步发展为肠系膜脂膜炎。例如患有类风湿关节炎等自身免疫性疾病的患者，相对更容易出现肠系膜脂膜炎相关的病理改变。