附睾炎的治疗需根据病情采取综合措施，一般来说，急性附睾炎可通过药物等治疗，多数能在数周内改善。
药物治疗选择
抗生素应用： 急性附睾炎多由细菌感染引起，常用抗生素有头孢类，如头孢曲松等，能抑制细菌细胞壁合成，从而发挥杀菌作用。如果是衣原体、支原体感染导致的附睾炎，可选用阿奇霉素等大环内酯类抗生素，它能抑制细菌蛋白质合成。非甾体抗炎药： 对于有疼痛症状的患者，可使用布洛芬等非甾体抗炎药，这类药物通过抑制环氧化酶活性，减少前列腺素合成，达到抗炎、镇痛的效果，一般能在用药后数小时缓解疼痛症状。
一般治疗方法
休息与抬高阴囊： 患者需要充分休息，卧床时可将阴囊抬高，这样有助于促进血液回流，减轻肿胀和疼痛。一般建议休息1 - 2周，在此期间尽量减少活动。局部冷敷或热敷： 在急性期（通常是发病72小时内）可进行冷敷，每次冷敷15 - 20分钟，每天3 - 4次，能减轻肿胀和疼痛。而在急性期过后，可改为热敷，促进局部血液循环，帮助炎症消退，热敷温度不宜过高，以40℃左右为宜。
手术治疗情况
脓肿引流： 如果附睾炎形成脓肿，且经药物治疗效果不佳时，就需要进行手术引流。比如脓肿较大，直径超过2 - 3厘米，通过B超等检查明确有明显脓肿形成，就需要通过手术切开引流，引流出脓液后，炎症会逐渐消退。附睾切除： 这种情况比较少见，一般是在附睾炎反复发作，严重影响生活，且其他治疗方法无效时才会考虑。但附睾切除会对生育等功能有一定影响，需要谨慎评估后再决定是否手术。