植物神经功能紊乱的临床症状表现多样，涉及多个系统。一般来说，其心血管系统方面，患者可能出现心悸，自觉心跳加快、心慌，有时心电图可能无明显异常，但患者能明显感觉到心脏跳动异常；还可能有胸闷，感觉胸部发闷、憋气，仿佛有重物压迫胸部。
消化系统症状表现
胃肠功能紊乱： 患者会出现食欲减退的情况，明明没有饥饿感，看到食物也不想吃。还可能有腹胀，腹部感觉胀满不适，肚子鼓鼓的。有的患者会有腹痛，疼痛部位不固定，可为隐痛、胀痛等。另外，便秘和腹泻可能交替出现，比如一段时间排便困难，大便干结，接下来又可能出现腹泻，大便稀薄。
神经系统症状表现
头痛头晕： 头痛的程度和性质不一，可能是隐痛、胀痛或跳痛等，头晕则表现为头部昏沉、眩晕感，尤其在活动后可能加重。睡眠障碍： 患者常常入睡困难，躺在床上很久都难以入眠；或者睡眠浅，容易惊醒，睡眠质量差，导致第二天精神萎靡，困倦乏力。
其他系统症状表现
出汗异常： 有的患者会出现多汗的情况，尤其是在情绪紧张、激动时，或者无缘无故地大量出汗，可能是全身出汗，也可能是局部多汗，比如手心、脚心、额头等部位出汗较多。还有的患者会有无汗的情况，相对较少见，但也可能出现。性功能障碍： 在男性患者中，可能出现阳痿、早泄等问题；女性患者可能有月经不调，比如月经周期紊乱、月经量异常等情况。