怀孕了在肚子里是能够进行亲子鉴定的。
一、关于亲子鉴定的方式：
1.羊水穿刺：怀孕后若要做亲子鉴定，可通过羊水穿刺获取胎儿DNA样本，然后与父亲的DNA进行对比，以此来判断亲子关系。需要注意的是，并非任何时候都适宜进行，通常最好在怀孕16至20周之间前往医院进行。
2.静脉血采集：这也是亲子鉴定的一种方式，准确率较高。
3.绒毛样本采集：同样可以进行亲子鉴定。
二、怀孕时间对亲子鉴定的影响：
(1)如果怀孕时间过早进行亲子鉴定，可能会给胎儿的生长发育带来不利影响，较易引发先兆流产症状，此时可以等待一段时间，待胎儿发育稳定后再进行羊水穿刺检查，这样伤害相对较小且更安全。
(2)怀孕时间过早还可能因为羊水不足而无法进行DNA鉴定。
总之，怀孕时进行亲子鉴定需要考虑怀孕时间、鉴定方式等因素，以确保鉴定的可行性和安全性。