脸上起扁平疣可采取多种方式治疗。
一、药物治疗：若扁平疣情况不算严重，往往可外用如水杨酸软膏、维A酸软膏或咪喹莫特乳膏进行涂抹。水杨酸软膏能软化角质，促进扁平疣消退；维A酸软膏可调节表皮细胞增殖和分化，对扁平疣有一定作用；咪喹莫特乳膏能诱导机体产生抗病毒免疫反应来去除扁平疣，帮助症状逐渐恢复。
二、激光治疗：当扁平疣数目相对较少时，可运用激光手术来治疗。通过激光产生的高温使皮损组织碳化，进而实现去除扁平疣的效果。
三、液氮冷冻治疗：借助低温使组织坏死脱落，从而达到去除扁平疣的目的，这种方法操作简便且较为安全。
总之，针对脸上的扁平疣，可根据具体情况选择合适的治疗方法。