女性尿道口囊肿的症状主要有局部肿物、排尿异常以及局部不适等。一般来说，尿道口囊肿较小时可能无明显症状，随着囊肿增大，症状会逐渐显现。
局部肿物表现
外观可见肿物： 女性尿道口囊肿最直观的症状是能在尿道口部位看到或摸到一个小肿物，大小不一，小的可能如米粒般，大的直径可达1 - 2厘米左右。肿物通常呈圆形或椭圆形，表面光滑。位置相对固定： 囊肿位于尿道口附近，位置比较固定，一般不会随意移动。
排尿异常情况
排尿不畅： 当囊肿较大时，可能会阻塞尿道口，导致排尿不畅，表现为尿线变细、排尿费力等。例如，原本排尿流畅的女性，会感觉排尿时需要更用力才能排出尿液。尿频尿急： 由于囊肿对尿道的刺激，可能会引起尿频、尿急的症状。患者会频繁产生尿意，而且很难控制排尿，经常刚尿完不久又有尿意。
局部不适感觉
疼痛不适： 部分患者会感到尿道口部位有疼痛不适的感觉，尤其是在排尿时，尿液刺激囊肿可能会加重疼痛感，这种疼痛可为隐痛或刺痛。异物感： 患者能明显感觉到尿道口有异物存在，感觉不太舒服，这种异物感会持续存在，影响日常生活和心理状态。
其他可能伴随症状
继发感染时的表现： 如果囊肿发生继发感染，还可能出现局部红肿、发热等症状，尿道口周围皮肤可能会发红、肿胀，触摸时有温热感，同时可能伴有少量脓性分泌物。