闭经的治疗药物需根据病因选择，常见的有雌激素类药物，如戊酸雌二醇，可用于因雌激素缺乏导致的闭经，一般需要按疗程服用；孕激素类药物，像黄体酮，能用于因体内孕激素不足引起的闭经，通常使用一段时间后停药会来月经。
内分泌调节类药物
雌激素制剂： 对于因卵巢功能减退、雌激素水平低下引发的闭经，戊酸雌二醇是常用药物。它能补充体内雌激素，改善因雌激素缺乏导致的一系列症状，但使用时需注意可能出现恶心、呕吐等不良反应，且有血栓风险的人群要慎用。孕激素制剂： 黄体酮可用于治疗因孕激素不足引起的闭经。一般停药后3 - 7天会出现撤退性出血，不过长期使用可能会影响体内激素平衡，使用前需排除妊娠等禁忌情况。
促排卵类药物
克罗米芬： 适用于有排卵需求的闭经患者，它能竞争性结合下丘脑雌激素受体，干扰内源性雌激素的负反馈，促使垂体分泌更多促性腺激素，从而促进排卵。但可能会引起腹胀、腹痛等不良反应，而且有严重肝肾功能损害的患者禁用。来曲唑： 也可用于诱导排卵治疗闭经，其作用机制是通过抑制芳香化酶，减少雌激素合成，从而解除雌激素对垂体的负反馈，促进卵泡发育和排卵。使用过程中要监测卵泡发育情况，部分患者可能出现潮热、头痛等不适。
针对特定病因的药物
甲状腺素制剂： 如果闭经是由甲状腺功能减退引起，需要服用左甲状腺素钠片。它能补充甲状腺素，纠正甲状腺功能减退状态，一般需要长期服用，且要定期监测甲状腺功能指标来调整剂量，服用过量可能会出现心悸、手抖等甲亢样症状。溴隐亭： 对于因高泌乳素血症导致的闭经有较好疗效。它能抑制垂体泌乳素分泌，从而恢复月经和排卵。但部分患者服用后会出现恶心、眩晕等不适，有严重精神病史的患者禁用。