甲状腺穿刺一般疼痛感比较轻微，多数人能耐受，就像被轻轻刺一下的感觉。
穿刺时的感受因素
穿刺操作本身：甲状腺穿刺是用很细的针抽取甲状腺病变部位的细胞等组织，整个过程时间较短，一般在10 - 30分钟左右。在穿刺过程中，因为针比较细，所以产生的疼痛相对较轻。通常在穿刺前会进行局部麻醉，麻醉后穿刺时的疼痛就会大大减轻，很多人只会感觉到轻微的刺痛或者胀痛感。个体差异影响：不同人对疼痛的敏感程度不一样。有些人痛觉神经比较敏感，可能会觉得穿刺时的感觉相对明显一些；而痛觉神经不那么敏感的人，可能就觉得只是有一点点不适。比如一些痛觉阈值高的人，可能感觉甲状腺穿刺就像被蚊子叮了一下似的轻微不适。
穿刺前后的注意事项
穿刺前准备：穿刺前医生会对穿刺部位进行消毒等操作，患者要放松心情，配合医生。如果过于紧张，可能会放大对疼痛的感觉。一般不需要特殊禁食等准备，但要按照医生的要求做好相关准备工作。穿刺后护理：穿刺后要注意按压穿刺部位一段时间，防止出血。穿刺部位可能会有轻微的疼痛或不适，一般短时间内就会缓解。如果穿刺后疼痛持续不缓解或者有加重的情况，要及时告知医生。比如穿刺后24小时内尽量不要让穿刺部位沾水，避免感染等情况发生。
与其他检查疼痛对比
与抽血疼痛对比：甲状腺穿刺的疼痛比抽血要轻很多。抽血是比较粗的针头扎进血管，而甲状腺穿刺的针很细，所以穿刺时的疼痛程度远低于抽血时的疼痛。与一些小手术疼痛对比：和一些小手术相比，甲状腺穿刺的疼痛可以忽略不计。小手术可能会有较大的创口，术后恢复过程中疼痛持续时间也较长，而甲状腺穿刺几乎没有明显的创口，疼痛很轻微且很快就会消失。