12岁男生的阴茎变长方法主要包括理疗、药物治疗以及手术治疗等。
一、理疗：
12岁男生正处于青春期，阴茎会逐渐开始快速发育。如果存在阴茎短小的情况，就需要及时就医，以明确是否有异常发育状况。对于阴茎发育落后的情况，可以先尝试理疗的方法，比如通过一些特定的物理手段来刺激阴茎的生长。
二、药物治疗：
当理疗效果不理想时，还可以考虑药物治疗途径，可注射能够促进阴茎发育的相关药物，以刺激其发育生长。
三、手术治疗：
若药物治疗效果也不佳，那就可能需要进行手术了。根据具体病情，可施行包皮环切术、阴茎延长术等手术方式。
在孩子的生长发育过程中，除了要重点关注阴茎发育外，还需留意身高、体重等全身性的发育有无异常。一旦发现异常情况，应尽快就诊，以免延误治疗时机。
总之，对于12岁男生的阴茎发育问题，要综合考虑各种方法，并且要密切关注孩子的整体发育状况，做到早发现、早诊断、早治疗。