小肚子隐隐作痛且下面有褐色分泌物，通常是由宫颈炎、子宫内膜炎等疾病所致，需在医生指导下进行治疗。具体如下：
一、宫颈炎：
1.症状表现：会出现脓性或脓血性白带增多，伴有下腹坠痛、腰背痛、性交疼痛以及尿路刺激症状，体温可能有轻微升高。若感染沿宫颈淋巴管向周围扩散，会引起宫颈上皮脱落甚至形成溃疡。
2.治疗方法：全身治疗主要采用抗生素，给药途径、剂量和疗程依据病原体及病情严重程度决定，目前首选药物为头孢曲松，备用药物有大观霉素、青霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星、依诺沙星等。
二、子宫内膜炎：
1.症状表现：内膜充血水肿，严重时表面可有脓性渗出物甚至形成溃疡，向下可蔓延至子宫肌层形成多发性小脓肿，镜下可见内膜有大量白细胞浸润。白带通常为稀薄水样，呈淡黄色，有时为血性白带。
2.治疗方法：在医生指导下使用广谱抗生素静脉滴注，如头孢菌素类头孢匹罗、喹诺酮类诺氟沙星联合甲硝唑用药。
总之，当出现小肚子隐痛伴褐色分泌物时，要及时就医，明确病因后进行针对性治疗。