尖锐湿疣的治疗难易程度与治疗目的相关。
一、若以临床治愈，即去除疣体、缓解症状为主要目标，那么相对容易治疗。在临床上存在多种的治疗手段，可根据医嘱进行联合运用以提升疗效。比如，利用激光、微波、电灼烧、光动力疗法等物理方式来清除疣体；或者运用局部药物，像咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶等展开治疗。通过积极且规范的治疗，尖锐湿疣通常都能实现临床治愈。一般来说，在治疗后6至9个月没有出现复发，就可视为临床治愈。
二、但要是以彻底治愈，也就是清除HPV病毒、根治尖锐湿疣为目的，就会比较困难。这是因为当前并没有专门针对HPV病毒的特效药物，治疗药物大多也只是局部用药，也可通过系统用药结合外用药物进行治疗，然而这仅仅能使病毒载量降低至参考下限，并非是完全根除。当人体免疫力下降时，病毒很可能会再度增殖从而导致复发。
总之，尖锐湿疣的治疗效果因治疗目的而异，患者应咨询专业医生以确定合适的治疗方法。