抗过敏药物有多种，不同药物副作用有所不同，一般来说，约有10% - 15%的人使用抗过敏药物可能出现一些副作用。
中枢神经系统方面的副作用
嗜睡： 像第一代抗组胺药，如氯苯那敏，就比较容易导致嗜睡。大约有20% - 30%服用这类药物的人会出现不同程度的嗜睡症状，表现为精神不振、困倦，影响日常的工作和学习，尤其是需要集中注意力的工作，比如开车等。兴奋： 少数人使用抗过敏药物后可能出现兴奋的情况，特别是儿童对某些抗过敏药物比较敏感时，可能会出现烦躁、难以入睡等兴奋表现。不过这种情况相对较少见，大约占使用人群的1% - 2%。
心血管系统方面的副作用
心悸： 个别使用抗过敏药物的人可能会出现心悸症状，这是因为药物可能影响心血管的功能调节。一般在用药后短时间内可能会感觉到心跳加快、心慌，不过大多数情况下是轻微的，停止用药后可逐渐缓解。血压变化： 某些抗过敏药物可能会引起血压的波动，比如个别患者使用后可能出现血压轻度升高或者降低的情况，但这种情况比较少见，发生率在1%左右。高血压或者低血压患者在使用抗过敏药物时需要特别监测血压变化。
消化系统方面的副作用
口干： 很多抗过敏药物会导致口干，发生率较高，大约有30% - 40%的人使用后会出现不同程度的口干症状，需要经常喝水来缓解。胃肠道不适： 部分人服用抗过敏药物后可能出现胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。一般来说，症状较轻，停药后多可恢复，不过对于本身有胃肠道疾病的患者，如胃溃疡、肠炎等，可能会加重原有病情，这类患者使用抗过敏药物时需要谨慎。