孕三十八周小肚子隐隐作痛，其原因可能包括胎儿体积增大、假性宫缩以及疾病因素等。具体如下：
一、胎儿体积增大：在孕三十八周时已处于孕晚期，临近预产期。随着胎儿不断成长，体积逐渐增大，子宫也随之增大，这就可能会牵拉子宫两侧韧带，从而导致小肚子出现隐隐作痛的情况。这属于正常现象，是临产前的常见表现，无需过度紧张，通常也无需进行特别治疗。
二、假性宫缩：一般情况下假性宫缩并无明显疼痛等不适表现，但当假性宫缩较为强烈，且在孕三十八周时伴随较高的宫缩压，尤其在临近产前，可能会引起小肚子隐隐作痛。此时建议多注意休息，若出现规律宫缩、见红、破水等情况，应及时前往医院待产。
三、疾病因素：如果是因细菌、病毒感染而引发阴道炎、尿路炎症、消化道炎症等，炎症因子刺激周围组织，可能导致孕三十八周时小肚子隐隐作痛，同时可能伴有会阴烧灼感、尿频、尿急、恶心、腹痛等症状。这时需要及时到医院就诊，同时通过B超、胎心监护等措施来观察胎儿的情况，并遵医嘱使用阿莫西林胶囊等药物进行改善。
总之，当孕三十八周出现小肚子隐隐作痛时，可先适度休息观察，如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常表现，要及时就医，以确保孕妇和胎儿的健康安全。