没有卵黄囊可能与多种因素有关。一般来说，怀孕早期通过B超检查发现没有卵黄囊，可能是孕周太小，比如怀孕时间不足5周时，做B超可能还看不到卵黄囊，通常再等1~2周复查可能就会出现。也可能是胚胎发育异常，染色体异常是常见原因之一，约50%~60%的早期流产是由染色体异常导致的，染色体数目或结构异常会影响胚胎正常发育，进而出现没有卵黄囊的情况。另外，母体因素也可能影响，如母体患有严重的全身性疾病，像糖尿病、高血压等，或者内分泌异常，如黄体功能不全、甲状腺功能减退等，都可能干扰胚胎正常着床和发育，导致没有卵黄囊。
孕周因素
受孕时间晚： 如果女性月经周期不规律，排卵期推后，实际受孕时间比较晚，那么怀孕后孕囊发育相对滞后，可能在早期做B超时还看不到卵黄囊。一般建议这种情况的孕妇过1~2周再复查B超，观察孕囊及卵黄囊的发育情况。孕周计算错误： 要是孕妇记错了末次月经时间，导致孕周计算有误，也可能出现本应看到卵黄囊的孕周却没看到的情况。所以准确记录末次月经时间很重要，能帮助准确判断孕周和胚胎发育状况。
胚胎发育异常
染色体数目异常： 常见的有三体综合征等，比如21 - 三体、18 - 三体等染色体数目异常的胚胎，往往无法正常发育出卵黄囊。这种情况通常是胚胎自身染色体在分裂过程中出现错误导致的，属于自然淘汰的一种情况。染色体结构异常： 像染色体缺失、易位等结构异常，也会影响胚胎的正常发育，使得卵黄囊不能正常出现。这类异常可能是父母遗传物质携带异常，或者在胚胎发育过程中受到外界不良因素影响导致染色体结构改变。
母体因素影响
全身性疾病： 母体患有严重的糖尿病，血糖控制不佳时，会影响胎盘的血供和营养物质传递，从而不利于胚胎发育，可能出现没有卵黄囊的情况。还有高血压患者，血压长期控制不好，也会影响子宫胎盘循环，影响胚胎正常发育。内分泌异常： 黄体功能不全时，卵巢分泌的孕酮不足，孕酮是维持妊娠所必需的激素，它不足就会影响胚胎着床和发育，导致没有卵黄囊。甲状腺功能减退的孕妇，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的生长发育，包括卵黄囊的形成。